"10 ปีผ่านไป โชคชะตาบทใหม่เริ่มต้นขึ้นอีกครั้ง" นักวิทยาศาสตร์จอมวายร้าย ดร.เฮล ได้นำกองทัพจักรวรรดิใต้ดินเข้าทำร้ายเหล่ามนุษย์ คาบูโตะ โคจิ ได้เข้าต่อต้านพร้อมกับหุ่นยนต์ขั้นสุดยอด มาชินก้า แซด เพื่อเป้าหมายเดียว ในการหยุดยั้งแผนการร้ายของดร. เฮล และนำสันติสุขกลับสู่โลก 10 ปี หลังจากการต่อสู้ครั้งสุดท้าย โคจิ ละออกจากหน้าที่นักบิน แล้วหันเหไปทำงานด้านวิทยาศาสตร์ตามรอยพ่อและปู่ของเขา แต่การจู่โจมที่ไม่คาดฝันก็เกิดขึ้น ณ ภูเขาไฟฟูจิ โชคชะตาของเหล่ามนุษยชาติกลายเป็นการเดิมพัน โดยในตอนนี้ทั้งหมดขึ้นอยู่ในมือของโคจิและมาชินก้า แซดแล้ว